AlphaGenome API：访问 DNA 序列调控代码解读模型的 Python 客户端

核心能力与快速开始

★ 2117 · Python

能做什么

通过 API 密钥访问 AlphaGenome 模型，对 DNA 序列进行多模态预测，包括基因表达、剪接模式、染色质特征和接触图谱；支持最长 1,000,000 碱基对的序列输入，多数输出可达到单碱基分辨率；提供变异效应预测（如 predict_variant）、自定义区间与本体术语查询；可访问 AlphaGenome Atlas 中全基因组预计算的变异效应得分（AVI）、特征重要性；附带可视化库用于绘制 matplotlib 图表，并提供教程、变异打分策略说明。

适用场景

适用于基因组调控研究中的变异效应预测、基因表达与剪接等功能的计算建模、小到中等规模分析（如分析有限数量的基因组区域或数百至数千个预测），以及使用 Atlas 预计算数据进行全基因组变异效应探索；可用于科研中的理论建模与研究用途。

项目形态

开发框架

部署方式

通过 Python 客户端调用云端 API，需要获取 API 密钥；仓库本地安装方式为克隆仓库后执行 pip install ./alphagenome。具体托管环境与部署架构未说明。

主要依赖

需要 Python 环境与 AlphaGenome API 密钥；依赖包括 NumPy、pandas、matplotlib、SciPy、anndata、protobuf、gRPC 等（见致谢列表）。具体硬件、算力或网络要求未说明。

使用限制

API 仅对非商业用途免费开放，受服务条款约束；输出及其他信息不得用于训练其他机器学习模型；预测仅用于理论建模与研究目的，不得用于临床决策或作为医疗及专业建议依据；查询速率随需求变化，预计算 Atlas 预测通常查询速率更高，其他预测更适合中小规模分析，可能不适合需要超过 100 万次预测的大规模分析；仅提及商用需通过 Google Cloud 获取。

许可证

Apache-2.0

最近推送

2026-09-08 21:06

资料检查：2026-09-15 07:00 · 卡片整理：2026-09-15 07:00
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