AlphaGenome Atlas:人类基因组中每个可能DNA字母变化的预测图谱
这件事讲了什么
Google DeepMind 发布了 AlphaGenome Atlas,这是一个包含人类基因组中约90亿个单字母DNA变异预测效果的平台。过去,要搞清楚每个基因变异在分子层面有什么影响,靠实验室一个个测试几乎不可能,因为数量太大。这次他们把 AlphaGenome 模型的预测提前算好,做成了一个1PB的数据集,还推出 AVI 评分,把变异的影响浓缩成一个数字,方便研究人员快速排序和筛选。目前,科研人员可以免费通过网站、API 或 Google Antigravity 中的技能使用它,虽然已经能用于罕见病和常见性状研究,但主要是面向学术研究开放。
可以使用的工具
文中可用工具
- AlphaGenome预测基因变异对生物过程影响的AI模型
- AlphaGenome Atlas提供全基因组变异预测的1PB数据集和网站门户
- AVI score将变异影响浓缩成一个数字,方便排序和筛选
- AlphaMissense预测改变蛋白质的DNA变异影响的模型
- AlphaGenome API通过编程接口访问AlphaGenome Atlas
- Google Antigravity提供AlphaGenome Atlas作为技能的平台
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