AI 资源库 · 已整理 8 项

生命科学

查看与生命科学相关的 AI 资讯、工具、Skill、工作流和开源项目。

面向生命科学领域客座研究员的公开招募

Anthropic 正在公开招募生命科学领域的客座研究员。学术机构、非营利组织或政府实验室的首席研究员及其团队可以提交项目申请,在 8 到 12 周内与 Anthropic 的研究人员合作,用 Claude 研究因果人类生物学、分子生物学、药物化学、药物发现和临床科学等问题。Anthropic 会免费提供模型和工具,成果将共同发表,数据和代码开源,研究者始终保留自己数据的所有权。申请不需要提交私有数据,只需公开信息,窗口约 14 天,入选者会在截止后约 14 天收到邮件通知。

文中可用工具

  • Claude用于生命科学研究的 AI 模型,由 Anthropic 免费提供模型和工具支持
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OpenAI 收购 Orchestra Bio

OpenAI 宣布收购 Orchestra Bio 公司。此前,生物医药研发团队在做药物开发时,许多运营环节效率不够高,新疗法的推进速度受到限制。这次 OpenAI 打算把自己的人工智能能力用在生命科学的研发运营上,帮助这些团队加快药物开发、推动新疗法问世。对读者来说,这意味着未来药企可能用上更智能的研发运营方式;不过材料没有说明具体怎么用、收购金额和完成时间,也没有说普通用户现在能不能用上相关产品。

文中可用工具

提供的材料未提及具体可用工具。

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将 GPT-Rosalind 引入学术研究实验室

OpenAI 推出 Rosalind 学术计划,让符合条件的学术实验室可以免费获得 GPT-Rosalind 的使用权限和相关工具。此前学术实验室若要使用这类先进模型,通常需要自行解决费用或权限问题。该计划通过赞助的方式提供访问,目标是支持生命科学研究。目前材料只说明这是一个面向学术实验室的赞助计划,未说明具体资格标准、开放时间或可用范围。

文中可用工具

  • GPT-Rosalind面向生命科学研究的模型,符合条件的高校实验室可通过学术计划获得赞助访问
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为生命科学构建智能体框架:Deep Life Sci 发布

LangChain 推出了 Deep Life Sci,一个开源的生命科学智能助手,面向临床和实验室科研人员。此前通用的 AI 助手缺少生命科学领域的专业知识和数据接入,而生物医药专用产品又往往闭源且昂贵。Deep Life Sci 能直接检索 ClinicalTrials.gov 上 60 多万项临床研究、2900 万篇 PubMed 摘要和 1200 万篇 PubMed Central 全文,还能在安全沙箱里跑代码做数据分析、把任务分给数百个子智能体,并读取 PDF、图像、表格、序列等文件。对药企和科研团队来说,它开源可改,能接入自家数据、换用不同模型,并通过 LangSmith 的追踪与评测看到实际效果。

文中可用工具

  • Deep Life Sci开源的生命科学智能助手,帮科研人员检索文献、分析数据
  • Deep AgentsLangChain 的智能体框架,Deep Life Sci 建立在其之上
  • LangSmith用于追踪和评测智能体表现的平台,含沙箱功能
  • ClinicalTrials.gov提供 60 多万项注册临床研究记录的数据源
  • PubMed提供 2900 万篇论文摘要的数据源
  • PubMed Central提供 1200 万篇全文文章的数据源
  • Claude文中作为通用 AI 助手被提及,称其缺少生命科学领域知识
  • ChatGPT文中作为通用 AI 助手被提及,称其缺少生命科学领域知识
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在医疗与生命科学中扩展智能体:来自 Madrigal Pharmaceuticals、Abridge 和 Vizient 的经验

这篇文章讲的是,医疗和生命科学行业也在用 AI 智能体(能自动完成多步任务的程序),但这里的规矩比别的行业严得多。比如,一个错误答案可能涉及病人安全,所以光产品好用不够,还得能审计、合规、随时说清楚 AI 干了什么。文中举了三家机构的例子:Madrigal Pharmaceuticals 做了一个内部多智能体平台,帮员工查资料、做分析;Abridge 把医生和病人的对话自动变成病历,还能在整个流程里持续帮忙;Vizient 则让医院能查询原本锁在各个系统里的数据。对读者的用处是:能了解这个行业落地 AI 时最看重的可观测性、评估和成本控制,以及哪些场景已经产生了实际回报。

文中可用工具

  • Madrigal Pharmaceuticals 企业多智能体平台帮助员工跨结构化系统、文档和外部来源搜索、分析和综合证据
  • Abridge将医患对话转化为临床文档,并在临床工作流中提供持续智能体支持
  • Vizient GenAI 平台让医疗服务提供者查询原本孤立的医院数据,回答投资回报或成本效益等问题
  • LLM gateway统一查看不同用户和模型的花费,在扩大智能体自主权前控制成本
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DeepVariant:基于深度学习的基因组变异检测流程

google/deepvariant · DeepVariant is an analysis pipeline that uses a deep neural network to call genetic variants from next-generation DNA sequencing data.

DeepVariant 是 Google 开源的分析流程,将比对后的 DNA 测序reads(BAM/CRAM)转换为pileup图像张量,用卷积神经网络分类,最终输出标准 VCF/gVCF 变异结果,支持二倍体生物种系变异检测,覆盖 Illumina/Element、PacBio HiFi、Oxford Nanopore、Complete Genomics 等多种测序平台,并包含 DeepTrio 用于三口之家/双人变异检测。模型仅在人类数据上训练,用户可下载 Docker 镜像或预编译二进制运行,也支持 GPU/TPU 加速。

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构建AI以加速科学进步并改善生活

Google发布了一篇总结文章,介绍其用AI加速科学、改善健康的进展。过去AI研究虽多,但普通人受益有限,这次Google展示了多个已落地的工具:比如AlphaGenome Atlas公开了人类基因组所有90亿个单字母变异的预测影响;WeatherNext 3天气模型降水预报准确率提高50%,已用于产品;结核病筛查AI在6个国家分析了超过2.5万张X光片。此外,糖尿病视网膜病变AI已支持超过115万次筛查,乳腺癌研究显示AI能发现25%此前被遗漏的间期癌症。这些进展意味着AI正从实验室走向实际应用,帮助医生更早发现疾病、预测灾害,让更多人获得医疗和科学资源。

文中可用工具

  • AlphaGenome Atlas公开人类基因组所有90亿个单字母变异的预测影响,供研究人员使用
  • WeatherNext 3全球天气模型,提供更准确的降水预报,已用于产品中
  • Planetary Prediction Engine整合全球健康、粮食安全和社会经济数据,预测全球危机
  • AlphaFold预测已知的2亿个蛋白质结构,用于疾病研究和药物发现
  • AlphaMissense帮助研究人员识别导致疾病的基因突变
  • Health Acoustic Representations通过咳嗽声检测结核病的生物声学模型
  • Co-Scientist协作式AI工具,帮助研究人员加速科学方法的核心步骤,如生成和验证新假设
  • DeepConsensus开源AI工具,用于理解人类基因组
  • DeepVariant开源AI工具,用于理解人类基因组
  • DeepPolisher开源AI工具,用于理解人类基因组
  • AMIE (Articulate Medical Intelligence Explorer)推进纵向疾病管理,辅助前线护理,让医生有更多时间陪伴患者
  • AI & Economy ATLAS交互式洞察工具,展示全球人们如何使用AI
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AlphaGenome Atlas:人类基因组中每个可能DNA字母变化的预测图谱

Google DeepMind 发布了 AlphaGenome Atlas,这是一个包含人类基因组中约90亿个单字母DNA变异预测效果的平台。过去,要搞清楚每个基因变异在分子层面有什么影响,靠实验室一个个测试几乎不可能,因为数量太大。这次他们把 AlphaGenome 模型的预测提前算好,做成了一个1PB的数据集,还推出 AVI 评分,把变异的影响浓缩成一个数字,方便研究人员快速排序和筛选。目前,科研人员可以免费通过网站、API 或 Google Antigravity 中的技能使用它,虽然已经能用于罕见病和常见性状研究,但主要是面向学术研究开放。

文中可用工具

  • AlphaGenome预测基因变异对生物过程影响的AI模型
  • AlphaGenome Atlas提供全基因组变异预测的1PB数据集和网站门户
  • AVI score将变异影响浓缩成一个数字,方便排序和筛选
  • AlphaMissense预测改变蛋白质的DNA变异影响的模型
  • AlphaGenome API通过编程接口访问AlphaGenome Atlas
  • Google Antigravity提供AlphaGenome Atlas作为技能的平台
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