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资源与用法

44 份资源

DeepVariant:基于深度学习的基因组变异检测流程

google/deepvariant · DeepVariant is an analysis pipeline that uses a deep neural network to call genetic variants from next-generation DNA sequencing data.

DeepVariant 是 Google 开源的分析流程,将比对后的 DNA 测序reads(BAM/CRAM)转换为pileup图像张量,用卷积神经网络分类,最终输出标准 VCF/gVCF 变异结果,支持二倍体生物种系变异检测,覆盖 Illumina/Element、PacBio HiFi、Oxford Nanopore、Complete Genomics 等多种测序平台,并包含 DeepTrio 用于三口之家/双人变异检测。模型仅在人类数据上训练,用户可下载 Docker 镜像或预编译二进制运行,也支持 GPU/TPU 加速。

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★ 3808 · 可直接使用的工具

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DeepConsensus:用间隙感知序列 Transformer 校正 PacBio CCS 测序数据错误

google/deepconsensus · DeepConsensus uses gap-aware sequence transformers to correct errors in Pacific Biosciences (PacBio) Circular Consensus Sequencing (CCS) data.

DeepConsensus 是 Google 开源的生物信息学工具,利用间隙感知(gap-aware)序列 Transformer 对 PacBio 环形一致性测序(CCS)数据进行纠错,从而提升高质量读段的产出量。它运行在 PacBio 测序后的 subreads 上,生成 FASTQ 格式的校正读段,可替代 CCS/HiFi 读段用于下游变异检测与基因组组装分析;README 提供了产出率、运行时间与组装指标等文档,并给出 pip、Docker 与源码的安装方式及建议的计算配置。

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★ 265 · 研究实现

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AlphaGenome Research:统一 DNA 序列模型的科研实现与变体效应预测

google-deepmind/alphagenome_research · Research code accompanying AlphaGenome

AlphaGenome 是 Google DeepMind 提出的统一 DNA 序列模型,可分析最长 100 万碱基对的 DNA 序列,在单碱基分辨率下预测基因表达、剪接模式、染色质特征和接触图等多种模态。本仓库提供该模型的研究代码:基于 JAX 的模型实现、AlphaGenome API 及变体打分器、从 TFRecords 读取训练数据的数据集加载器,以及用于运行模型和评估分析的 Colab notebook。预训练权重可从 Kaggle 或 Hugging Face 下载,需接受非商业模型条款。

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★ 867 · 研究实现

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system_prompts_leaks:主流 AI 产品系统提示词泄露汇编

asgeirtj/system_prompts_leaks · Extracted system prompts from Anthropic - Claude Fable 5.1, Opus 5, Claude Design, Claude Code. OpenAI - ChatGPT GPT-6-Astra, Codex. Google - Gemini 3.8 Flash, 3.1 Pro, Antigravity. xAI - Grok, Grok Bot, Cursor, Kimi and more! Updated regularly.

该仓库按厂商分类收录从 Anthropic Claude、OpenAI ChatGPT 与 Codex、Google Gemini、xAI Grok、Perplexity、Microsoft Copilot、Cursor、Meta AI、Kimi、OpenCode 等产品中提取的系统提示词原文,并持续更新最新模型版本的提示词、子智能体、技能与命令文件。可用于研究各家 AI 产品的隐藏指令、行为规则与提示词工程实践,也作为构建自有系统提示词的参考资料。仓库本身为提示词与文档合集,不包含模型或可运行推理代码。

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程序员参考仓库中 Claude Code、Codex、Cursor、GitHub Copilot、Gemini CLI 等编码类 AI 产品的系统提示词、子智能体、技能与命令文件,研究其隐藏指令与行为规则,作为编写自有编码助手系统提示词和提示词工程实践的参考资料。

产品经理参考仓库中 ChatGPT、Claude、Gemini、Grok、Perplexity 等主流 AI 产品按厂商分类收录的系统提示词原文,研究其行为规则与提示词工程实践,作为构建自有 AI 产品系统提示词的参考资料。

★ 65991 · 资料合集

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